Od 15. 9. 2025 nabývá účinnosti nový Pokyn GFŘ-D-72, který reaguje na červencovou novelu zákona č. 280/2009 Sb., daňového řádu (dále jako „DŘ“). Ta nově umožňuje finančním úřadům promíjet až 100 % penále (dosud max. 75 %).

OD KDY SE NOVÁ ÚPRAVA POUŽIJE?

• Nový režim se vztahuje pouze na penále vzniklé od 1. 7. 2025.
• Rozhodující je datum oznámení dodatečného platebního výměru, nikoliv zdaňovací období, ke kterému se penále váže.

JAKÉ JSOU HLAVNÍ ZMĚNY?

1. Prominutí až 100 % penále

Standardně lze prominout max. 75 % penále, a to na základě míry součinnosti daňového subjektu při doměření daně – tento „starý režim“ zůstává.

Nově lze prominout celých 100 %, ale jen ve vybraných případech:

• „Ospravedlnitelná situace“ (§ 259a odst. 2 DŘ):
  Pokyn uvádí jedinou jasně definovanou situaci:
  „Daňovým subjektem bylo podáno nepřípustné dodatečné daňové tvrzení ještě před zahájením kontroly a správce daně údaje z něj využil při stanovení daně, přičemž doměřená daň nepřesahuje dvojnásobek původně tvrzené daně.“ V takovém případě se přiznává 100% prominutí penále. Pokyn ale zároveň připouští, že mohou existovat i jiné ospravedlnitelné situace nad rámec výslovné definice – tedy prostor pro úvahu správce daně.

• Zákaz dvojího trestání (§ 259a odst. 5 DŘ):
  Pokud byl daňový subjekt pravomocně potrestán za daňový trestný čin a k téže dani vzniklo i penále, pokyn stanovuje tabulkově, v jakém rozsahu lze penále prominout (podle druhu a výše uloženého trestu).

2. Procesní novinky

• postup pro situace, kdy se prominutí kombinuje se soudním přezkumem,

Pokud daňový subjekt napadne rozhodnutí o doměření daně žalobou, běží mu zároveň lhůty a možnosti podat žádost o prominutí příslušenství. Pokyn výslovně řeší, jak má správce daně postupovat při současném prominutí a probíhajícím soudním řízení – tedy aby se zamezilo dvojímu posuzování téže otázky a aby se rozhodnutí navzájem „nevymazávala“. Prakticky to znamená, že prominutí není blokováno samotným soudním přezkumem, ale správce daně musí brát v úvahu jeho výsledek.

• zpřesnění v oblasti lhůt, poplatků a podmínek žádostí,

Lhůta pro podání žádosti o prominutí penále je 3 měsíce od právní moci platebního výměru (§ 259a odst. 3 DŘ). Pokyn podrobně popisuje případy tzv. stavění lhůty – např. při povolení posečkání, nebo pokud soud přizná odkladný účinek žalobě. Cílem je zamezit nejasnostem, kdy daňové subjekty zmeškávaly lhůtu, protože běh času se „zastavil“ a oni si to neuvědomili.

Žádost o prominutí je zpoplatněna správním poplatkem 1 000 Kč, pokud jde o částku nad 3 000 Kč. Pokyn upřesňuje situace, kdy se poplatek vybírá (např. za každý druh daně zvlášť, i když jde o jedno zdaňovací období). Zároveň vyjasňuje výjimky – např. u společného předmětu zdanění (typicky manželé a daň z nabytí nemovitých věcí).

• úpravu, že i uhrazené příslušenství lze zpětně prominout,

Nově se výslovně potvrzuje, že úhrada příslušenství není překážkou prominutí. To znamená, že i když subjekt penále nebo úroky už zaplatí, může dodatečně požádat o jejich odpuštění a dostat peníze zpět.

• detailní výčet situací, kdy prominutí nelze (např. u závažných porušení daňových nebo účetních předpisů v posledních 3 letech).

Pokyn zpřesňuje, kdy nelze prominout – zejména pokud subjekt v posledních 3 letech závažně porušil daňové nebo účetní předpisy (např. status nespolehlivého plátce DPH, opakované nepodání přiznání). Nově se také detailně rozlišuje, co už je „závažné porušení“ a co ne – což by mělo vést k předvídatelnějším rozhodnutím.

Zdroje:

[1] Pokyn č. GFŘ-D-72 k promíjení příslušenství daně

[2] Finanční zpravodaj číslo 12/2025

[3] Zákon č. 280/2009 Sb., daňový řád v platném znění